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同様の症状で困ってましたが、タスクマネージャに、conime.exeというのが動いてたら停止させてみてください。

私が気付いた範囲でいくつか。

conime.exeが起動している時点で、コマンドプロンプトからTerrariaを起動して、コマンドプロンプトを終了させるのを忘れていませんか？
もしくは、batファイルなどから起動していませんか？
トロイの木馬がconime.exeに化けている可能性は、無料のオンラインウィルススキャンなどで確認しましたか？
参考URL　http://www.windowsfiles.jp/fairu/conime.exe.html

まずは、終了方法だけでなく、起動方法と常駐させているソフトや、裏で起動していたソフトについて
相性的に怪しいものが無かったか、ざっくり確認をオススメします。

例えば、クリック自動連打ソフトで無限に黒曜石採掘しながら放置して出勤し帰宅、クリック自動連打ソフトを終了させずにTerrariaを終了したとか、
起動したものの寝落ちして数時間放置していたらOP画面のままTerrariaが応答不能になったとか、
ほっぺにキーボの跡が付くくらい、どのキー押してたか分からない状態にしてしまったとか、
Cドライブ（SSD）の空き容量が1k切っててワールドデータ更新に失敗してフリーズしてくれやがった上にアイテムロストとワールド巻き戻りのオマケがあった、などなど・・・
他には、Terrariaを終了させている途中で（タスクマネージャー上でTerraria.exeがリストから消える前に）、Steamに終了しろと言っていませんか？
※ここまで全部、私がSteamを正常終了出来なかった時の例

力技で解決する前に、まずは落ち着きましょう。（お前が言うｎ（ｒｙ

どちらにせよ、状況判断のための資料が少なくて、何とも言えない気がします。
もう少し具体的な状況が分かれば、何か分かる方がいらっしゃるかもしれませんよ。