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Marble wallはそのまま無関係ですね。自然生成された背景壁はあってもなくても変わりません。 壊してもいいですが、わざわざ壊す必要もないので放置されただけだと思います。 ブロック類は人工・自然という区分け自体が無いので、プレイヤーが好きに設置して大丈夫です。
身も蓋もない言い方をすれば、Hoptileを出現させるだけならMarble biomeは必要ありません。 地下の適当な場所に大理石ブロックを一直線に並べて、その真ん中にプレイヤーが立つだけでもホプリタイとメデューサは湧きます。 面倒くさければプレイヤーの足元だけ大理石でもいいです。確率は低めですがそれでも湧きました。